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El Comité de Operaciones de Emergencia Municipal, está compuesto por distintas instituciones como Policía, Crem, Defensa Civil, Bomberos, Hospitales, Centros de Salud y diversas organizaciones, con el fin de trabajar organizadamente ante una catástrofe o accidente múltiple.
De esta forma, en el caso de la Gripe A H1 N1, desde la Secretaría de Salud, se trabajó con el objetivo de fortalecer el primer nivel de atención y gracias a la aplicación de la Emergencia Sanitaria decretada por el Municipio de Quilmes, se supo que hubo un impacto positivo al disminuir notablemente las internaciones en el hospital Isidoro Iriarte.
Además, para combatir la pandemia, se generaron mecanismos de articulación entre el sector público y el privado. También se implementaron mecanismos de seguimiento ambulatorio con promotores de salud quienes realizaron un monitoreo telefónico de los pacientes que se atendieron en los centros de salud de los barrio. Con los pacientes del Hospital de Quilmes también se realizó la misma metodología.